Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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