Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDX39BQ13838 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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