Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KRR1Q13601 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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