Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRPF4BQ13523 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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