Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SF3B2Q13435 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SF3B2Q13435 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms