Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms