Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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