Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms