Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SELENBP1Q13228 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SELENBP1Q13228 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms