Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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IFT88Q13099 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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IFT88Q13099 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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IFT88Q13099 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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IFT88Q13099 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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