Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
STRN3Q13033 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.3 ms