Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PRDM2Q13029 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PRDM2Q13029 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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