Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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