Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTP4A2Q12974 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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