Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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FOXC1Q12948 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXC1Q12948 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXC1Q12948 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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