Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNTN1Q12860 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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