Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXO1Q12778 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXO1Q12778 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms