Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ACADSBP45954 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ACADSBP45954 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms