Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms