Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP18Q9UMW8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP18Q9UMW8 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
USP18Q9UMW8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP18Q9UMW8 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP18Q9UMW8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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