Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms