Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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