Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C9orf78Q9NZ63 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms