Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ERGIC2Q96RQ1 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERGIC2Q96RQ1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms