Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CCDC47Q96A33 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CCDC47Q96A33 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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