Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms