Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms