Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PKN1Q16512 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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