Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK4Q16099 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms