Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZIC1Q15915 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms