Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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VAMP3Q15836 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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VAMP3Q15836 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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VAMP3Q15836 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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VAMP3Q15836 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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VAMP3Q15836 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
VAMP3Q15836 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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