Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
HERC1Q15751 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms