Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms