Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
GAPVD1Q14C86 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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GAPVD1Q14C86 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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GAPVD1Q14C86 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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GAPVD1Q14C86 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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GAPVD1Q14C86 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GAPVD1Q14C86 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
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