Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SHROOM2Q13796 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms