Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
APOFQ13790 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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APOFQ13790 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
APOFQ13790 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
APOFQ13790 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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