Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RUNX3Q13761 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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