| RUNX3 | Q13761 | OXR1-215 | ENST00000531443 | 3599 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR13G1-202 | ENST00000642119 | 2568 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSG8-202 | ENST00000401467 | 1686 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.167-201 | ENST00000363735 | 109 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.303-201 | ENST00000364998 | 94 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-715P-201 | ENST00000365204 | 103 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354864.1-201 | ENST00000373226 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ26-201 | ENST00000390511 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR764-201 | ENST00000390811 | 85 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA16.2-201 | ENST00000390991 | 127 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-46P-201 | ENST00000410818 | 138 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1148P-201 | ENST00000410992 | 104 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP111-201 | ENST00000411386 | 101 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P16-201 | ENST00000452205 | 344 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.638-201 | ENST00000459374 | 113 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP34-201 | ENST00000487776 | 387 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS29P20-201 | ENST00000489592 | 171 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02220-201 | ENST00000510065 | 270 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-826P-201 | ENST00000516827 | 104 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-143P-201 | ENST00000516942 | 93 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PKIA-203 | ENST00000518467 | 588 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021698.1-201 | ENST00000524858 | 716 nt | TSL 3 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157871.3-201 | ENST00000557231 | 293 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1273C-201 | ENST00000578669 | 77 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | uc_338.11-201 | ENST00000619132 | 160 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003400.5-201 | ENST00000624827 | 617 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTP4A2-220 | ENST00000627328 | 615 nt | TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR219B-201 | ENST00000637023 | 88 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM59-205 | ENST00000371348 | 1911 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4G1P-203 | ENST00000641984 | 1631 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PKIB-201 | ENST00000258014 | 1595 nt | TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NACAP2-201 | ENST00000318548 | 624 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-371P-201 | ENST00000364283 | 108 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-522P-201 | ENST00000364497 | 107 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1180P-201 | ENST00000364935 | 107 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ40-201 | ENST00000390497 | 61 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD3D-202 | ENST00000392884 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL26P27-201 | ENST00000414397 | 437 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005062.1-207 | ENST00000418442 | 587 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365496.1-201 | ENST00000426885 | 215 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092427.1-202 | ENST00000430569 | 476 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073342.1-202 | ENST00000446192 | 457 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPFP3-201 | ENST00000457792 | 225 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-23P-201 | ENST00000459465 | 62 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000852.1-201 | ENST00000472460 | 573 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27AP10-201 | ENST00000496103 | 208 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108210.2-201 | ENST00000503681 | 201 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116353.2-201 | ENST00000505332 | 712 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008539.1-201 | ENST00000507653 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UQCRB-202 | ENST00000517523 | 515 nt | TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P6-201 | ENST00000549284 | 499 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02301-203 | ENST00000555798 | 789 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096708.3-201 | ENST00000584226 | 559 nt | TSL 2 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P15-201 | ENST00000585707 | 270 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | uc_338.34-201 | ENST00000617467 | 174 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010722.1-201 | ENST00000622595 | 582 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPBP1-201 | ENST00000264779 | 1786 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51A4-202 | ENST00000641898 | 4393 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACTR6-212 | ENST00000552376 | 1659 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z82195.2-201 | ENST00000612348 | 18351 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R13-201 | ENST00000390677 | 1637 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TECRL-202 | ENST00000507440 | 2876 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XPO4-202 | ENST00000400602 | 9884 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.378-201 | ENST00000365652 | 113 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-877P-201 | ENST00000383868 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA67.3-201 | ENST00000384366 | 140 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD37.1-201 | ENST00000390968 | 65 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MDM2-210 | ENST00000393413 | 657 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL606923.1-201 | ENST00000406616 | 190 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1025P-201 | ENST00000410629 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.615-201 | ENST00000410769 | 117 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062039.1-201 | ENST00000414394 | 565 nt | TSL 2 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160162.1-202 | ENST00000417654 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPEP10-201 | ENST00000420249 | 274 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P30-201 | ENST00000423237 | 256 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC241644.2-201 | ENST00000426504 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF274573.2-201 | ENST00000437772 | 520 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093579.1-201 | ENST00000439455 | 352 nt | TSL 2 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BRK1P2-201 | ENST00000442875 | 223 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069542.1-201 | ENST00000445235 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA18-201 | ENST00000459004 | 134 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P26-201 | ENST00000463169 | 339 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAF1-205 | ENST00000509434 | 385 nt | TSL 3 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097375.2-201 | ENST00000510416 | 579 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114316.1-201 | ENST00000511323 | 278 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112206.3-201 | ENST00000514578 | 389 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1178P-201 | ENST00000516674 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025755.1-201 | ENST00000521306 | 278 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC134698.4-201 | ENST00000523451 | 826 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137161.1-201 | ENST00000532231 | 390 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MDM2-233 | ENST00000545204 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02309-201 | ENST00000553679 | 207 nt | TSL 3 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |