Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms