Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SNTA1Q13424 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SNTA1Q13424 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SNTA1Q13424 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNTA1Q13424 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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