Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDE3BQ13370 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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