Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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ITGB3BPQ13352 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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ITGB3BPQ13352 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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ITGB3BPQ13352 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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ITGB3BPQ13352 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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ITGB3BPQ13352 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGB3BPQ13352 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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