Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SKP2Q13309 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SKP2Q13309 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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