Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRIM28Q13263 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRIM28Q13263 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms