Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF5Q13243 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms