Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAF3Q13114 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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TRAF3Q13114 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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TRAF3Q13114 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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TRAF3Q13114 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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