Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTP4A2Q12974 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTP4A2Q12974 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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