Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RBBP4Q09028 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms