Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms