Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPS29P62273 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RPS29P62273 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RPS29P62273 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RPS29P62273 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms