Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TTPAP49638 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TTPAP49638 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TTPAP49638 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TTPAP49638 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms